中国农科院科技创新工程，是我国深化科技体制改革的一个缩影。
为什么要改革？中国农科院科技管理局副局长张军民解释：“农业科研周期长、投入大、见效慢，原有一些管理机制手段不能适应，有的甚至制约了创新。”
当时，竞争性的科研项目大多“短平快”，科研人员追着项目跑，研究方向不稳定，难以形成积累和重大突破。在农业科研上，这方面的弊端尤为明显。
科技创新工程推行伊始，有人担心：稳定支持会不会变成搞平均主义？通过设计准入、考核机制，中国农科院形成了以团队首席领衔的动态集体，不仅没有“养懒人”，团队轻装上阵后科研实力普遍提升。
项目支持方式的外在之变，驱动了内在创新理念跨越。
“作为农业科研‘国家队’，我们不能只考虑今天，还要做明天、后天的事。”张军民表示，“一句话，要围绕国家重大需求做科研。”
作物科学研究所团队牵头发现水稻中具有高产潜力的重要基因，为作物同步实现高产、早熟提供了解决方案；植物保护研究所团队构建农作物有害生物防控体系，“虫口夺粮”保丰收……随着科技创新工程深入实施，解难题、做大事成为越来越多科研团队的自觉担当。
科技创新工程也在不断升级。中国农科院出台“科技创新工程跃升计划”，国家农作物育种科学中心、国家畜禽育种科学中心等9大科学中心悉数亮相。
“人员集中到团队，团队集中到中心，打破团队、研究所界限，‘举院抓大事’探索有组织的科研，为的就是急国家之所需。”张军民表示。
科技创新工程启动当年，中国农科院便首次向全球发布用人信息，招聘植物保护研究所所长职位，浙江大学教授周雪平成功应聘。探索新的用人制度，折射出中国农科院开门开放、以研为先、以人为本的新型人才培养任用机制。
2017年，中国农科院启动实施“农科英才”工程，按照顶端人才、领军人才、青年英才进行稳定支持，让优秀人才脱颖而出。
“只要对科研有益的尝试，有困难也要做。”张军民说，面对学科发展不平衡、交叉新兴学科不足的挑战，中国农科院还将继续探索。
中国农科院院长吴孔明表示，作为国家战略科技力量，中国农科院要勇于改革，推动我国农业科技自立自强加速取得重大突破，为建设农业强国作出新的贡献。